鸡IGF1、IGF2基因的遗传互作效应
摘要:以IGF1、IGF2基因作为影响鸡生产性能的候选基因,采用DNA测序和PCR-SSCP技术分析2个基因的单核苷酸多态性及互作效应。结果表明,IGF1基因P1位点与IGF2基因P2位点对12、16周龄鸡的质量存在互作效应。
关键词:鸡;遗传多样性;IGF1R基因;IGFBP-3基因;互作效应
中图分类号:S831.2文献标志码: A文章编号:1002-1302(2015)11-0285-02
收稿日期:2014-11-27
基金项目:江苏省重点实验室开放课题(编号:K13032);江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(13)3044]。
作者简介:金崇富(1985—),男,江苏建湖人,硕士研究生,助理研究员,主要从事动物遗传育种与繁殖研究。Email:jincf001@sina.com。
通信作者:陈应江,副研究员,主要从事畜牧业研究。胰岛素样生长因子(IGFs)是人体最重要的生长因子之一。IGF家族由2个多肽类生长因子(IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ)、2类受体(IGF-ⅠR、IGF-ⅡR)、7种结合蛋白(IGFBP1-7)组成,它们是动物生长轴上的重要因子,具有强烈的促生长和分化作用[1]。类胰岛素样生长因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)是介导生长素作用的物质,在研究生长素的促生长作用时被发现并深入研究。类胰岛素样生长因子-Ⅱ(insulin-like growth factor-Ⅱ,IGF2)是调节动物生命活动最重要的多肽生长因子之一[2],是生长激素发挥作用的中间信使,进而发挥促进生长发育的作用[3]。
王慧华研究发现,IGF1基因G49754A/G49778A位点对京海黄鸡的初生质量有显著影响[2]。Amills等在IGF-Ⅰ基因的5′-UTR发现,HinfI-RFLP与107 d鸡的日增质量存在相关性[4]。杨凤萍等在京海黄鸡IGF2基因中检测到外显子2发生G→C突变,并与其生产性状具有显著相关性[5]。李源等研究发现,IGF2基因C2C2型个体的12、16周龄质量极显著大于C1C2型个体(P<0.01)[3]。
在分析多基因调控的数量性状时,须同时分析多个位点,以便得到基因与性状之间的真实相关性,从而在利用DNA标记进行辅助选择时获得更大的遗传进展[6]。以江苏省盐城市地方草鸡为研究对象,分析IGF1、IGF2基因的互作效应,以期为盐城市地方草鸡生产性状的分子遗传机制研究提供依据。
1材料与方法
1.1试验材料
在江苏沿海地区农业科学研究所生态养殖基地的母鸡群中,翅静脉采集138份血样,每份1.5 mL,以ACD抗凝并于 -20 ℃ 保存备用。用DNA提取试剂盒抽提基因组DNA。
1.2引物设计
1.3PCR-SSCP分析
将2.5 μL PCR产物添加至7.5 μL变性缓冲液中,98 ℃变性10 min,随后迅速冰浴5 min。将变性的PCR产物点样添加至10%聚丙烯酰胺凝胶中,于140 V电压电泳12 h。电泳结束后进行银染显色并拍照记录结果。
1.4IGF1、IGF2基因综合标记
采用SPSS软件的广义线性模型(GLM)综合分析IGF1、IGF2基因的互作效应,选取互作效应显著的鸡,对其生产性状进行基因型组合,并对不同基因型组合间的差异进行最小二乘(LSD)分析。
2结果与分析
2.1PCR-SSCP分析结果
采用PCR-SSCP分析P1、P2引物扩增片段。P1扩增片段有3种带型,定义为AA、AB、BB(图1);P2扩增片段有3种带型,定义为CC、CD、DD(图2)。
2.2序列分析结果
由引物P1的PCR产物片段测序结果(图3)可知,BB型与AA型相比在160 bp处发生了G→A突变。由引物P2的PCR产物片段测序结果(图4)可知,DD型与CC型相比在1 087 bp处发生了G→A突变。
2.3IGF1、IGF2基因对生产性状的互作效应
由IGF1、IGF2基因对生产性状的互作效应(表1)可知,IGF1、IGF2基因对盐城市地方草鸡的12、16周龄质量存在互作效应。
3结论与讨论
培育具有综合性能的优良家禽品种已成为现代家禽育种的重要目标。由于家禽的很多经济性状是由多基因控制的数量性状,可通过分子标记选择世代中含有多个目标基因的个体,再从中选出优良个体,实现有利基因的聚合,使品种具有更优良的生产性能。
通过分子标记将多个影响家禽生产性状的基因聚合,此方面的研究尚不多见。侯启瑞在京海黄鸡群体中对IGF1与IGF2、LYZ与gag-env分别进行聚合分析,发现其存在互作效应[7]。赵秀华在京海黄鸡群体中对IGFBP-1、IGFBP-2、STAT5基因进行3基因互作效应分析,结果表明,3基因合并效应>2基因合并效应>单基因效应,且组合基因型效应不是单基因型效应的简单相加,其效果优于单基因型效应[8]。李国辉等以白耳鸡为试验对象,检测GH、POU1F1、PRL基因的单核苷酸多态性,分析3个基因的单基因效应与聚合基因型效应[9]。本研究中盐城市地方草鸡IGF1、IGF2基因对其12、16周龄质量具有互作效应;在生产中,可通过选择这2个基因的SNPs进行分子标记辅助育种,其风险低于单基因选择。
参考文献:
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